... nicht spurlos an der Abteilung 1 des Amtes für Öffentliche Sicherheit vorbeigegangen. So wäre es dem kriminellen Genie Shôgo Makishima beinahe gelungen, durch ein gezieltes Attentat auf die zentrale Nahrungsmittelversorgung Japans dass Sibyl System zu stürzen. Der einstige Vollstrecker Shin'ya Kôgami ist immer noch als gesuchter Mörder auf der Flucht, während Inspektor Nobuchika Ginoza aufgrund der eigenen Farbtontrübung seines Amtes entbunden wurde und fortan nur noch als Vollstrecker arbeiten darf. Um die personellen Engpässe zu bewältigen wird neben zwei neuen Vollstreckern die Nachwuchsinspektorin Mika Shimotsuki zu ihrem Dienst in Abteilung 1 einberufen. Als es zu einem Bombenanschlag in einer belebten Fußgängerzone kommt, gelingt es den Beamten anhand eines Bekennervideos den Tatverdächtigen ausfindig zu machen. Doch ihre Ermittlungen führen sie zu einem weitaus gefährlicheren Kriminellen, der von seinen Anhängern Kamui genannt wird. Dieser ist nicht nur in der Lage, den Farbton eines Menschen zu beeinflussen und kriminelle Individuen zu reinigen, sondern scheint es zudem auf die Inspektoren des Amtes für Öffentliche Sicherheit abgesehen zu haben.